Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 4930402F11Rik-203ENSMUST00000208289 606 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm5373-201ENSMUST00000212113 1050 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm45735-201ENSMUST00000212779 319 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC166902.1-201ENSMUST00000216653 517 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Ear-ps9-202ENSMUST00000226796 245 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn1r72-201ENSMUST00000053134 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm24031-201ENSMUST00000083930 131 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps45-201ENSMUST00000174138 2435 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Ugp2-202ENSMUST00000102875 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm42909-201ENSMUST00000196982 3619 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr358-202ENSMUST00000216437 4962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 2700069I18Rik-201ENSMUST00000128815 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Rab5a-ps-201ENSMUST00000203252 653 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm6982-201ENSMUST00000118752 1560 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn2r26-201ENSMUST00000032238 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Med21-203ENSMUST00000111650 572 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Sh3bp1P55194 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn1r113-201ENSMUST00000168794 894 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm28703-201ENSMUST00000185312 1159 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm37209-201ENSMUST00000194109 1276 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr580-ps1-201ENSMUST00000210528 943 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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