Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Snora30-201ENSMUST00000083325 130 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr1249-201ENSMUST00000099769 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr224-202ENSMUST00000215322 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Creb5-203ENSMUST00000203528 7917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Zfp583-202ENSMUST00000108560 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Nlrp4e-201ENSMUST00000076470 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr221-205ENSMUST00000216907 2859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
VdrP48281 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Zfp143-202ENSMUST00000169638 2914 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Clvs1-202ENSMUST00000108348 3526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Trbv12-1-201ENSMUST00000103267 389 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm13363-201ENSMUST00000122008 522 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 2310016D23Rik-201ENSMUST00000130082 388 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm15870-201ENSMUST00000132657 644 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 BC050972-202ENSMUST00000169153 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm22655-201ENSMUST00000174949 96 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm37573-201ENSMUST00000193993 931 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC112956.1-201ENSMUST00000213563 492 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm25512-201ENSMUST00000083863 107 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Ifi206-201ENSMUST00000160565 3047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Vmn2r-ps128-201ENSMUST00000176367 2570 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Rtl9-201ENSMUST00000165829 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
VdrP48281 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.49
VdrP48281 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
VdrP48281 Gm43359-201ENSMUST00000197944 2200 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
VdrP48281 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
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VdrP48281 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
VdrP48281 Olfr695-201ENSMUST00000216868 3953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
VdrP48281 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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VdrP48281 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Gm22916-201ENSMUST00000157616 119 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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VdrP48281 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm31026-201ENSMUST00000198762 821 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm7407-201ENSMUST00000208301 568 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
VdrP48281 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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