Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm11321-201ENSMUST00000121257 902 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Vmn1r-ps20-201ENSMUST00000176809 915 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Mgat4c-212ENSMUST00000179929 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm42486-201ENSMUST00000200369 3486 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Has2-201ENSMUST00000050544 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 5830405F06Rik-201ENSMUST00000192753 1755 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm42888-201ENSMUST00000202425 4361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Fcf1-202ENSMUST00000171040 731 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Csn1s2a-209ENSMUST00000200322 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AV026068-237ENSMUST00000226075 572 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Abi3bp-204ENSMUST00000171000 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm38286-201ENSMUST00000195128 3105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm11260-201ENSMUST00000121163 942 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm16260-201ENSMUST00000155141 304 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Ndst4-204ENSMUST00000173932 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AY358078-201ENSMUST00000053821 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Vmn1r63-201ENSMUST00000075085 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 AC122408.2-201ENSMUST00000217901 1391 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Hnrnpr-207ENSMUST00000148843 21452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
PtprmP28828 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm5762-201ENSMUST00000119204 258 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm38093-201ENSMUST00000195210 710 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm19987-201ENSMUST00000216339 499 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm46234-201ENSMUST00000218702 259 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Lcn4-201ENSMUST00000028283 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr845-201ENSMUST00000071259 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Cnot1-202ENSMUST00000098473 8390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm15875-201ENSMUST00000152264 273 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm37560-201ENSMUST00000194289 1000 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm7652-201ENSMUST00000200440 1151 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm44649-201ENSMUST00000205608 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm46138-201ENSMUST00000215294 426 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Prl8a9-201ENSMUST00000006662 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gabrb1-201ENSMUST00000031122 13737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Klra11-ps-201ENSMUST00000122033 810 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PtprmP28828 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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