Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC158641.1-201ENSMUST00000218933 229 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm3829-201ENSMUST00000222362 619 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC122937.1-201ENSMUST00000226405 793 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Cr2-212ENSMUST00000210219 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm43259-201ENSMUST00000198446 3277 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11797-201ENSMUST00000121336 754 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AI847159-202ENSMUST00000138431 952 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm25438-201ENSMUST00000158281 110 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r122-201ENSMUST00000164409 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r159-201ENSMUST00000167871 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r126-201ENSMUST00000168398 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm4207-201ENSMUST00000173144 960 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm29359-201ENSMUST00000191007 495 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm37001-201ENSMUST00000193377 190 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm45639-201ENSMUST00000211205 710 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm9655-201ENSMUST00000211321 1284 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 CT030161.1-201ENSMUST00000218411 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC159293.2-201ENSMUST00000222289 424 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 AC154692.1-201ENSMUST00000228314 544 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Vmn1r114-201ENSMUST00000098737 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm10670-201ENSMUST00000098744 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r93-201ENSMUST00000098747 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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Ccl20O89093 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11506-201ENSMUST00000122414 470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 9130015L21Rik-201ENSMUST00000140319 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Vmn1r160-201ENSMUST00000171745 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Obox4-ps8-201ENSMUST00000175831 714 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm27025-201ENSMUST00000182392 942 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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