Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Agbl2-208ENSMUST00000170320 4507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Zbed4-ps2-201ENSMUST00000187003 3448 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm17655-202ENSMUST00000210275 1776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm19084-201ENSMUST00000222939 1762 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r235-201ENSMUST00000060603 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21122-201ENSMUST00000191548 3452 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Catsperg2-201ENSMUST00000061193 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm13503-201ENSMUST00000119017 446 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm17421-201ENSMUST00000167845 674 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm45628-201ENSMUST00000210849 274 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm45261-201ENSMUST00000211023 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Kat6b-ps1-201ENSMUST00000187624 3433 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Ankar-202ENSMUST00000211837 4543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Dennd4c-204ENSMUST00000142837 5870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
Hdac6Q9Z2V5 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC103672.3-201ENSMUST00000227649 3243 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Macc1-202ENSMUST00000221866 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC116797.1-201ENSMUST00000223988 3955 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Scgb2b3-201ENSMUST00000108090 339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Rps15a-ps4-201ENSMUST00000119415 392 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm13632-201ENSMUST00000150119 384 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm17152-201ENSMUST00000172430 535 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm23925-202ENSMUST00000188429 132 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Tlr5-202ENSMUST00000191820 3818 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm32308-201ENSMUST00000203053 280 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Gm45070-201ENSMUST00000208100 246 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 Rps26-ps1-202ENSMUST00000212102 351 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
Hdac6Q9Z2V5 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms