Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Gm21991-201ENSMUST00000180006 508 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Mir7676-1-201ENSMUST00000183491 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Mir7676-2-201ENSMUST00000183523 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm18861-201ENSMUST00000202509 1186 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm18193-201ENSMUST00000210017 772 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm45434-201ENSMUST00000210550 293 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm46233-201ENSMUST00000217831 449 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm46327-201ENSMUST00000218240 365 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Olfr1463-201ENSMUST00000064102 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Gm8267-201ENSMUST00000165003 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Zfp493-201ENSMUST00000164936 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Six6Q9QZ28 Olfr810-202ENSMUST00000214206 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm36960-201ENSMUST00000195491 2035 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm4724-203ENSMUST00000152941 1198 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm23554-201ENSMUST00000157818 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Glipr1-204ENSMUST00000162508 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm43525-201ENSMUST00000196460 616 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm11913-201ENSMUST00000119094 336 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 Gm22961-201ENSMUST00000157964 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm43227-201ENSMUST00000202239 677 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Six6Q9QZ28 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr788-201ENSMUST00000056961 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Olfr427-201ENSMUST00000080831 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm44842-201ENSMUST00000209173 3372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Fbxw28-201ENSMUST00000112039 1497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Six6Q9QZ28 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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