Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm16208-201ENSMUST00000128476 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm23233-201ENSMUST00000157301 137 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm8600-201ENSMUST00000186320 905 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm45004-201ENSMUST00000205302 465 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm44765-201ENSMUST00000206927 601 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm43154-210ENSMUST00000210190 1051 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Olfr944-202ENSMUST00000213908 1257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 AC153961.2-201ENSMUST00000218877 164 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm9318-201ENSMUST00000222444 438 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 AC154846.2-201ENSMUST00000228805 424 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Olfr345-201ENSMUST00000076850 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm22293-201ENSMUST00000083314 109 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Rsrc2-210ENSMUST00000182489 1665 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm18757-201ENSMUST00000207938 3141 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Dtna-203ENSMUST00000220904 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Mrpl1-203ENSMUST00000121477 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 1700001G01Rik-201ENSMUST00000125117 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Smg9Q9DB90 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Smg9Q9DB90 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Smg9Q9DB90 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Rps11-ps2-201ENSMUST00000121547 456 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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Smg9Q9DB90 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Smg9Q9DB90 Zc4h2-203ENSMUST00000120620 2156 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
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Smg9Q9DB90 Btbd35f16-201ENSMUST00000185755 1949 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Enpp2-203ENSMUST00000171545 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Olfr1111-202ENSMUST00000214492 1616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 AC121870.1-201ENSMUST00000216279 4879 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm43210-201ENSMUST00000196743 6152 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Dcun1d1-212ENSMUST00000198389 3020 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Smg9Q9DB90 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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