Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23594-201ENSMUST00000104307 134 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11890-201ENSMUST00000119585 417 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem29-211ENSMUST00000163233 1256 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21883-201ENSMUST00000179028 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21789-201ENSMUST00000179547 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21870-201ENSMUST00000179973 372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Olr1-204ENSMUST00000183258 468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Ankrd12-201ENSMUST00000038116 8991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Pdzrn3Q69ZS0 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r90-202ENSMUST00000226264 7796 ntAPPRIS P2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43281-201ENSMUST00000202522 2704 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Snord66-201ENSMUST00000104051 75 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn1r88-201ENSMUST00000171783 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 1700010K23Rik-201ENSMUST00000174502 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 A630095N17Rik-202ENSMUST00000180101 571 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37399-201ENSMUST00000195224 416 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44077-201ENSMUST00000203453 435 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44736-201ENSMUST00000205943 667 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC131720.2-201ENSMUST00000220420 431 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC154371.1-201ENSMUST00000226600 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Cypt3-201ENSMUST00000056754 666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mup14-201ENSMUST00000071005 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Mir346-201ENSMUST00000083547 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 n-R5s3-201ENSMUST00000083879 112 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr1066-201ENSMUST00000099885 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 AC154227.1-201ENSMUST00000228809 2467 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 mt-Nd4-201ENSMUST00000082414 1378 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Vmn2r112-201ENSMUST00000097381 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pof1b-201ENSMUST00000039887 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44144-201ENSMUST00000203683 1960 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Nr3c2-202ENSMUST00000109911 3804 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11409-201ENSMUST00000118621 403 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11631-201ENSMUST00000119220 156 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11881-201ENSMUST00000119408 572 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Pdcl2-202ENSMUST00000122213 1049 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Pdzrn3Q69ZS0 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms