Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm45002-201ENSMUST00000208045 120 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 AC167013.4-201ENSMUST00000226712 317 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm43363-201ENSMUST00000201590 2647 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Fap-209ENSMUST00000174448 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Ccdc186-201ENSMUST00000076085 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Fgb-201ENSMUST00000048246 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Mospd2-202ENSMUST00000112247 2479 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Klf7-202ENSMUST00000114086 7662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Dnase2b-201ENSMUST00000029836 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm36799-202ENSMUST00000215783 1634 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr406-202ENSMUST00000214303 2842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Igkv5-43-201ENSMUST00000103368 379 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm25415-201ENSMUST00000104220 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 n-R5s67-201ENSMUST00000104336 114 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm12939-201ENSMUST00000117303 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm13664-201ENSMUST00000117304 345 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm27723-201ENSMUST00000157398 63 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Rpl9-ps1-202ENSMUST00000182502 576 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm8241-201ENSMUST00000189286 816 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 CT868720.2-201ENSMUST00000221207 413 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 AC154431.2-201ENSMUST00000225215 1055 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm22628-201ENSMUST00000082988 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Gm29486-201ENSMUST00000088648 372 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Spata22-201ENSMUST00000117445 3200 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Pramef6-202ENSMUST00000105767 1967 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Tsr1Q5SWD9 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Arhgef38-202ENSMUST00000147041 6541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Psg16-202ENSMUST00000118367 2282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm43088-201ENSMUST00000197530 2347 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr193-203ENSMUST00000208455 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Abi3bp-201ENSMUST00000048471 4687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Rnf24-201ENSMUST00000059372 5978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Tsr1Q5SWD9 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Tsr1Q5SWD9 Pfdn6-206ENSMUST00000179418 514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Mir6336-201ENSMUST00000183581 130 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm28023-201ENSMUST00000184556 60 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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Tsr1Q5SWD9 Ly6c2-203ENSMUST00000188214 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Ly6e-215ENSMUST00000191436 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Ighv1-6-201ENSMUST00000193849 293 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm5552-201ENSMUST00000197149 515 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 4930526M16Rik-201ENSMUST00000197305 954 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm2059-201ENSMUST00000212025 287 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Platr26-201ENSMUST00000079720 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Mir3068-201ENSMUST00000083004 136 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm15773-201ENSMUST00000118665 1448 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr281-202ENSMUST00000217517 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Gm44676-201ENSMUST00000208520 3055 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Tsr1Q5SWD9 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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