Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Ddx3y-201ENSMUST00000091190 4600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
Trim71Q1PSW8 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Igkv8-19-201ENSMUST00000103389 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm23754-201ENSMUST00000157576 63 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r163-201ENSMUST00000164537 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r135-201ENSMUST00000170931 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 V1rd19-201ENSMUST00000173571 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm38053-201ENSMUST00000193938 160 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm5660-201ENSMUST00000197453 1149 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm43635-201ENSMUST00000202533 352 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr850-202ENSMUST00000211832 947 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr986-201ENSMUST00000062229 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Mir465-201ENSMUST00000093563 74 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Ktn1-215ENSMUST00000189101 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Pde1a-206ENSMUST00000102655 4258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1140-203ENSMUST00000217572 1327 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Sult6b1-204ENSMUST00000169544 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm38104-201ENSMUST00000195121 1895 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm23431-201ENSMUST00000104006 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm6592-201ENSMUST00000115563 507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14714-201ENSMUST00000119743 439 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14977-201ENSMUST00000121626 812 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm7855-201ENSMUST00000137737 687 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm28364-201ENSMUST00000187908 334 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Trim71Q1PSW8 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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