Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24429-201ENSMUST00000104076 132 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14909-201ENSMUST00000117853 351 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 4930558N11Rik-204ENSMUST00000211512 516 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC153505.2-201ENSMUST00000217741 277 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm31931-201ENSMUST00000219666 222 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1341-201ENSMUST00000061215 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Cox6b2-201ENSMUST00000063324 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm23447-201ENSMUST00000082798 163 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25187-201ENSMUST00000083906 133 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Nebl-206ENSMUST00000131957 1709 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Prr11-201ENSMUST00000051395 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ccar1-201ENSMUST00000020268 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm12845-201ENSMUST00000203629 1767 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm19113-201ENSMUST00000217552 1828 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Cxcl11-202ENSMUST00000122808 3794 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14927-201ENSMUST00000120283 454 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm12095-201ENSMUST00000121962 816 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25292-201ENSMUST00000122797 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Pkib-209ENSMUST00000177325 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28390-201ENSMUST00000185212 700 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm44456-201ENSMUST00000196554 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm29781-201ENSMUST00000203862 478 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms