Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC154515.2-201ENSMUST00000226093 406 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 2610044O15Rik8-202ENSMUST00000186619 2337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Mef2c-223ENSMUST00000199105 4361 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Pkd1l3-202ENSMUST00000109242 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Fastkd5-202ENSMUST00000179273 2424 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Nlrp1b-204ENSMUST00000108516 4134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Igkv10-96-201ENSMUST00000103328 359 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm14521-201ENSMUST00000119545 350 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm11716-201ENSMUST00000154414 470 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Mir1970-201ENSMUST00000157839 104 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm25333-201ENSMUST00000158035 246 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm18306-201ENSMUST00000207338 569 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC107808.1-201ENSMUST00000213260 386 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm33654-201ENSMUST00000221704 215 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Lilra6-201ENSMUST00000038176 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Olfr1348-201ENSMUST00000086319 957 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 AC122769.3-201ENSMUST00000227739 3245 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Slc9a4-201ENSMUST00000027233 3962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Tulp4-201ENSMUST00000039655 9687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Rpusd2Q149F1 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 AC154576.1-202ENSMUST00000223966 3320 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Vmn2r25-201ENSMUST00000162046 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 CT009696.4-201ENSMUST00000213487 1801 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Olfr360-202ENSMUST00000216706 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm14628-201ENSMUST00000117508 635 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rpusd2Q149F1 Gm5886-201ENSMUST00000203420 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Rpusd2Q149F1 Olfr1315-ps1-202ENSMUST00000208654 945 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 2010005H15Rik-201ENSMUST00000063539 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 B020031M17Rik-201ENSMUST00000080505 522 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Olfr1316-201ENSMUST00000099596 945 ntAPPRIS P2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 AC155298.1-201ENSMUST00000225350 3250 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Golga1-202ENSMUST00000112850 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Dnal1-202ENSMUST00000123491 5727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 C1d-201ENSMUST00000000594 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Jade3-202ENSMUST00000115384 4866 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm37762-201ENSMUST00000194515 3561 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Tnfrsf26-201ENSMUST00000055723 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Ccl9-201ENSMUST00000019266 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Gm44789-201ENSMUST00000207195 3101 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Rpusd2Q149F1 Olfr1427-202ENSMUST00000215374 3342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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