Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm27676-201ENSMUST00000183669 61 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20897-201ENSMUST00000185240 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20906-201ENSMUST00000186493 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20824-201ENSMUST00000186739 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm37175-201ENSMUST00000192023 587 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm43556-201ENSMUST00000196186 681 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm18228-201ENSMUST00000217297 1091 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 AC168881.1-201ENSMUST00000226018 430 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Samt4-201ENSMUST00000026029 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Btbd35f13-201ENSMUST00000177912 1701 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Acsm3-205ENSMUST00000106529 3295 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Olfr172-202ENSMUST00000214139 1778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Nxf2-203ENSMUST00000113189 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Chek1-205ENSMUST00000173963 1509 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Cass4Q08EC4 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms