Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm12383-201ENSMUST00000120628 760 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm15168-201ENSMUST00000121057 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Magea9-ps-201ENSMUST00000140655 732 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm29329-201ENSMUST00000189053 621 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm28331-201ENSMUST00000191102 621 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18752-202ENSMUST00000193627 587 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm44134-201ENSMUST00000203064 661 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm44688-201ENSMUST00000209083 537 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 4930405J17Rik-201ENSMUST00000214323 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm26564-201ENSMUST00000216701 378 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm25800-201ENSMUST00000082636 134 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm25140-201ENSMUST00000083254 140 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Ncoa7-207ENSMUST00000215740 7043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 3110062G12Rik-201ENSMUST00000192113 1419 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm16246-201ENSMUST00000145464 1346 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm11639-203ENSMUST00000212287 17665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 2410012E07Rik-201ENSMUST00000190896 1357 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm24096-201ENSMUST00000103905 110 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir7028-201ENSMUST00000185016 64 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm29648-201ENSMUST00000188651 650 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Ralyl-205ENSMUST00000192209 662 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC168274.2-201ENSMUST00000219252 338 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC124524.2-201ENSMUST00000223940 588 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Spinkl-201ENSMUST00000066328 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 H2al1o-201ENSMUST00000079952 509 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Csn1s1-201ENSMUST00000094641 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1477-201ENSMUST00000214274 3913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14388-201ENSMUST00000118119 477 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14795-201ENSMUST00000118461 471 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm12186-201ENSMUST00000119050 945 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm6079-201ENSMUST00000121356 404 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Oosp2-202ENSMUST00000135994 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18505-201ENSMUST00000187360 790 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm21735-201ENSMUST00000190360 696 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm28155-201ENSMUST00000191066 151 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm37134-201ENSMUST00000195810 628 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms