Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 5430401F13Rik-202ENSMUST00000161385 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Mir496b-201ENSMUST00000184935 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm4557-201ENSMUST00000185826 907 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm4526-201ENSMUST00000186039 920 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm8708-201ENSMUST00000188500 906 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 5430401F13Rik-201ENSMUST00000075020 602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm24268-201ENSMUST00000082990 110 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Mrc1-201ENSMUST00000028045 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Scaper-205ENSMUST00000217647 4370 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Xkr9-201ENSMUST00000088542 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Rps27-206ENSMUST00000197361 329 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 Olfr875-201ENSMUST00000080634 1004 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
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SrprbP47758 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
SrprbP47758 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm7451-201ENSMUST00000208382 1392 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Trav6n-6-201ENSMUST00000103613 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Olfr1171-ps1-201ENSMUST00000118079 837 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 2210408F21Rik-202ENSMUST00000124811 384 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm13209-201ENSMUST00000138492 494 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm22870-201ENSMUST00000157501 112 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm24188-201ENSMUST00000157980 108 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm25874-201ENSMUST00000178030 79 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
SrprbP47758 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
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