Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Serpina6-201ENSMUST00000044159 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Poln-206ENSMUST00000202638 2814 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Zbed6-201ENSMUST00000190574 5007 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Zfp35-201ENSMUST00000074941 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Arsk-201ENSMUST00000120573 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Cyp2j6-201ENSMUST00000030303 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Il18r1-206ENSMUST00000195684 2850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Ralgapa2-202ENSMUST00000109986 11030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm42869-201ENSMUST00000199953 2121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm26514-201ENSMUST00000181087 4231 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Asap1-205ENSMUST00000175793 4314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr536-204ENSMUST00000215340 3938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24120-201ENSMUST00000103978 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13239-201ENSMUST00000119920 637 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm26372-201ENSMUST00000157831 236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mir219c-201ENSMUST00000199860 60 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC241534.1-201ENSMUST00000218537 399 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC099578.1-201ENSMUST00000220147 435 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm3800-201ENSMUST00000221086 554 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr682-ps1-201ENSMUST00000071242 934 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr502-201ENSMUST00000078933 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Ipo11-205ENSMUST00000186033 4147 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Zfp2-202ENSMUST00000109129 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC164297.2-201ENSMUST00000224388 1508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Nmd3-201ENSMUST00000029358 9135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Pik3c2g-202ENSMUST00000087657 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm44735-201ENSMUST00000206197 1752 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Trim30d-201ENSMUST00000033211 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Pcdh9-202ENSMUST00000192221 5161 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Igkv4-71-201ENSMUST00000101325 288 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm7219-201ENSMUST00000119619 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm25058-201ENSMUST00000157365 128 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm16132-201ENSMUST00000159296 598 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r-ps59-201ENSMUST00000174596 135 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mir3095-201ENSMUST00000175552 87 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.8 ms