Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 AC101945.4-201ENSMUST00000228464 1976 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr1226-207ENSMUST00000220416 3387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm25765-201ENSMUST00000104100 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm23481-201ENSMUST00000104173 131 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm12507-201ENSMUST00000119155 415 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Spink2-202ENSMUST00000120429 594 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm25369-201ENSMUST00000158848 132 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm22395-201ENSMUST00000177427 96 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm22111-201ENSMUST00000178010 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm23687-201ENSMUST00000178664 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm21834-201ENSMUST00000178907 453 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm24566-201ENSMUST00000179286 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm23305-201ENSMUST00000179342 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm26389-201ENSMUST00000179819 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm22130-201ENSMUST00000179979 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm22393-201ENSMUST00000180153 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm25085-201ENSMUST00000180298 79 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 AC134537.3-201ENSMUST00000220154 503 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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Ccl20O89093 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm37064-201ENSMUST00000193851 2231 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Tug1-202ENSMUST00000144852 4720 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr59-201ENSMUST00000143976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
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Ccl20O89093 CT010444.1-201ENSMUST00000219963 3845 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr810-204ENSMUST00000217283 4527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.9
Ccl20O89093 Vmn1r56-201ENSMUST00000169556 1832 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp931-202ENSMUST00000108924 962 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14399-203ENSMUST00000109059 703 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14399-205ENSMUST00000109062 626 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Anp32-ps-201ENSMUST00000118265 388 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm11917-201ENSMUST00000154813 373 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm25534-201ENSMUST00000175365 125 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
Ccl20O89093 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
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