Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Tsx-201ENSMUST00000033691 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Gm379J3QQ19 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Gm379J3QQ19 Gm23443-201ENSMUST00000082916 128 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Gm379J3QQ19 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
Gm379J3QQ19 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
Gm379J3QQ19 Olfr1404-203ENSMUST00000217374 3686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
Gm379J3QQ19 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Olfr735-202ENSMUST00000216634 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Rfpl4b-201ENSMUST00000179279 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm45063-201ENSMUST00000203726 472 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 AC159809.1-201ENSMUST00000216235 520 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Olfr715b-201ENSMUST00000081044 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm10212-201ENSMUST00000087884 324 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm20619-201ENSMUST00000175814 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm37868-201ENSMUST00000195578 2735 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 5730507A11Rik-201ENSMUST00000204297 3371 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm32014-201ENSMUST00000214779 5145 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Igkv9-124-201ENSMUST00000103312 287 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 5033423K11Rik-201ENSMUST00000117311 787 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm11876-201ENSMUST00000120002 269 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm22890-201ENSMUST00000158642 144 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm22501-201ENSMUST00000158981 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm45081-201ENSMUST00000206281 572 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Bsph1-201ENSMUST00000098811 822 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Olfr1137-201ENSMUST00000099850 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm36962-201ENSMUST00000192114 1761 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm15319-201ENSMUST00000084046 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm44527-202ENSMUST00000204519 1314 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm12880-201ENSMUST00000120652 494 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm12578-201ENSMUST00000121244 417 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm13431-201ENSMUST00000122948 476 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm15323-201ENSMUST00000156109 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Ear-ps12-201ENSMUST00000161720 451 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm15716-201ENSMUST00000162457 404 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm20397-201ENSMUST00000174520 362 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Mir6393-201ENSMUST00000183709 94 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm27805-201ENSMUST00000184513 79 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm40293-201ENSMUST00000202596 485 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Gm379J3QQ19 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms