Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14534-201ENSMUST00000120045 357 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16327-201ENSMUST00000137146 228 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps35-201ENSMUST00000169206 831 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20399-201ENSMUST00000174652 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29356-201ENSMUST00000186935 373 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45269-201ENSMUST00000210359 282 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9712-201ENSMUST00000210842 311 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009754.1-201ENSMUST00000223489 558 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4788-201ENSMUST00000027612 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr229-201ENSMUST00000076802 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psg25-201ENSMUST00000094795 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F9-201ENSMUST00000033477 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230057D06Rik-202ENSMUST00000207061 3717 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45030-201ENSMUST00000207575 1774 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrtm2-201ENSMUST00000091636 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17067-201ENSMUST00000166837 3673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42614-201ENSMUST00000198724 1554 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r169-205ENSMUST00000228832 2749 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12261-201ENSMUST00000117499 645 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl35-ps1-201ENSMUST00000118070 372 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11351-201ENSMUST00000139335 583 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12958-201ENSMUST00000141242 674 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AI662270-201ENSMUST00000142709 304 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45327-201ENSMUST00000211612 565 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35326-201ENSMUST00000218234 1041 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230081H15Rik-201ENSMUST00000218326 2929 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A530053G22Rik-201ENSMUST00000060147 1526 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr516-203ENSMUST00000217279 1441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmnc-201ENSMUST00000089832 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp976-203ENSMUST00000187616 1908 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms