Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Nuf2-202ENSMUST00000111368 2405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Prl3c1-202ENSMUST00000110364 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm13537-201ENSMUST00000120467 267 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 4930447N08Rik-201ENSMUST00000196290 497 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm34662-201ENSMUST00000220502 215 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Otor-201ENSMUST00000028902 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm23624-201ENSMUST00000082463 321 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 n-R5s46-201ENSMUST00000083960 116 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC155243.1-201ENSMUST00000220141 2262 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Smad2-203ENSMUST00000113930 1305 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm42819-201ENSMUST00000199630 5121 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm42436-201ENSMUST00000198804 3656 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14245-201ENSMUST00000118939 1843 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Tspan7-202ENSMUST00000115526 7067 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Zfp708-202ENSMUST00000109743 2536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Ino80d-206ENSMUST00000172416 13438 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Themis-203ENSMUST00000105516 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 AC124516.1-201ENSMUST00000221845 3544 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm4989-201ENSMUST00000118711 749 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Limd1Q9QXD8 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Rho-205ENSMUST00000203877 939 ntTSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Limd1Q9QXD8 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 CT033781.1-201ENSMUST00000223128 454 ntTSL 5 BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Limd1Q9QXD8 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
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Limd1Q9QXD8 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm37342-201ENSMUST00000194588 4965 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm37183-201ENSMUST00000191712 3405 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm45061-201ENSMUST00000204395 2095 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm22596-201ENSMUST00000157601 316 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm26172-201ENSMUST00000158421 134 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
Limd1Q9QXD8 Rhoay-ps2-201ENSMUST00000186362 581 ntBASIC6.42□□□□□ -1.38
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