Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Lrp1b-209ENSMUST00000185258 1874 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm2912-201ENSMUST00000223472 1799 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Vmn1r167-201ENSMUST00000164527 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Cox6b2-202ENSMUST00000182048 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Klrb1b-204ENSMUST00000205130 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 Gm38131-201ENSMUST00000192449 430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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Rnft1Q9DCN7 n-TStga1-201ENSMUST00000199903 109 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Rnft1Q9DCN7 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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