Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Mir7220-201ENSMUST00000183978 60 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm43116-201ENSMUST00000199789 195 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm5-202ENSMUST00000202386 420 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1087-201ENSMUST00000099877 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm37053-201ENSMUST00000192399 2087 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Satl1-201ENSMUST00000026601 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Zfp738-203ENSMUST00000137496 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm22370-201ENSMUST00000102422 83 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm5073-201ENSMUST00000118222 820 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 2610509F24Rik-201ENSMUST00000193035 838 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Med7-201ENSMUST00000020665 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm36243-201ENSMUST00000211546 610 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC156802.1-201ENSMUST00000223623 579 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 CT025689.2-201ENSMUST00000224979 429 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC192088.3-201ENSMUST00000227858 831 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm24043-201ENSMUST00000083108 116 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gprc6a-202ENSMUST00000218684 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r76-201ENSMUST00000165771 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Ryr3-202ENSMUST00000091818 15410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm15262-202ENSMUST00000207320 5010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Pgap1-201ENSMUST00000097739 10583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r81-204ENSMUST00000228482 13495 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Axdnd1-211ENSMUST00000213088 3561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr47-202ENSMUST00000215569 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Platr32-201ENSMUST00000148597 394 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm21917-201ENSMUST00000177831 666 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm29335-201ENSMUST00000188361 459 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm43428-201ENSMUST00000200108 3845 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC153662.1-201ENSMUST00000222220 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC173481.1-201ENSMUST00000223351 270 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Ubxn4Q8VCH8 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms