Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH4

Gcsam, Germinal center-associated signaling and motility protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcsamQ6RFH4 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 2810403D21Rik-203ENSMUST00000131640 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Zfp931-204ENSMUST00000131702 704 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm25667-201ENSMUST00000157701 275 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm25436-201ENSMUST00000158275 145 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm27392-201ENSMUST00000185041 101 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm17781-201ENSMUST00000195232 649 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm42470-201ENSMUST00000198086 251 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm30717-201ENSMUST00000206549 494 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm18116-201ENSMUST00000220920 537 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 AC133517.1-202ENSMUST00000224409 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 AC166095.1-203ENSMUST00000224591 233 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr824-203ENSMUST00000215217 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm43882-201ENSMUST00000204871 2264 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm16294-201ENSMUST00000070382 1459 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr354-202ENSMUST00000217479 9539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr801-204ENSMUST00000216067 4014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Cfhr1-201ENSMUST00000023965 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 A830011K09Rik-202ENSMUST00000162868 2201 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Olfr853-202ENSMUST00000213834 3888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 Cdc27-203ENSMUST00000106962 3160 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
GcsamQ6RFH4 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm13155-201ENSMUST00000119277 646 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm11719-201ENSMUST00000119399 351 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm8178-201ENSMUST00000121570 646 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm38279-201ENSMUST00000194067 1131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm2314-201ENSMUST00000200391 586 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Olfr1298-202ENSMUST00000208284 1563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 AC166343.1-201ENSMUST00000213261 577 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Olfr1058-202ENSMUST00000213998 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Ube2nl-201ENSMUST00000085228 456 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm10704-201ENSMUST00000098952 730 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Cubn-201ENSMUST00000091436 11262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm43870-201ENSMUST00000205102 4369 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm3972-201ENSMUST00000173960 2861 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Olfr1280-203ENSMUST00000219291 6883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Olfr1274-ps-202ENSMUST00000216111 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Spata31d1c-201ENSMUST00000099427 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Vmn2r-ps47-201ENSMUST00000174515 2557 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
GcsamQ6RFH4 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms