Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Adam34-201ENSMUST00000110411 2584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm43065-201ENSMUST00000198971 2092 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr397-202ENSMUST00000213134 4048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Trim30e-ps1-202ENSMUST00000151294 731 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm34091-201ENSMUST00000200875 604 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm18423-201ENSMUST00000205144 1074 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm13167-201ENSMUST00000118554 578 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm35857-201ENSMUST00000212739 178 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm29674-202ENSMUST00000219664 4083 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 4930559C10Rik-201ENSMUST00000223202 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC158392.2-201ENSMUST00000225402 969 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1002-202ENSMUST00000215548 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr429-201ENSMUST00000060693 943 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r171-207ENSMUST00000227774 2867 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Xiap-202ENSMUST00000055483 6374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Olfr492-201ENSMUST00000079865 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 March1-203ENSMUST00000098708 4000 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 2900018N21Rik-201ENSMUST00000195805 1580 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 C130023A14Rik-201ENSMUST00000193537 3087 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 St8sia4-204ENSMUST00000189556 10027 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm14622-201ENSMUST00000117117 468 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm11419-201ENSMUST00000150772 683 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NipblQ6KCD5 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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