Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm14093-201ENSMUST00000145579 364 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm24289-201ENSMUST00000157629 135 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Fgd4-206ENSMUST00000161861 8342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Smim9-201ENSMUST00000101433 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Trbv13-1-201ENSMUST00000103268 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr359-ps1-201ENSMUST00000115977 926 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gstm5-202ENSMUST00000167387 599 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm18900-201ENSMUST00000193218 584 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC164102.1-201ENSMUST00000220524 1553 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm26129-201ENSMUST00000082719 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Prlr-205ENSMUST00000128921 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm4788-202ENSMUST00000111986 2935 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm11673-201ENSMUST00000117846 331 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps92-201ENSMUST00000120775 517 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm2617-201ENSMUST00000185690 1066 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm39033-201ENSMUST00000209158 1021 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr885-201ENSMUST00000081985 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm37747-201ENSMUST00000193717 4003 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC154548.1-201ENSMUST00000225844 3838 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 BC002059-202ENSMUST00000190415 1964 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm13912-201ENSMUST00000156541 1860 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Olfr1019-202ENSMUST00000213515 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Mir711-201ENSMUST00000102188 82 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Olfr999-ps1-201ENSMUST00000122319 949 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 9330159F19Rik-201ENSMUST00000092627 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Wfdc18-201ENSMUST00000001009 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm23231-201ENSMUST00000157299 104 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm23668-201ENSMUST00000157465 111 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm23123-201ENSMUST00000157648 144 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm20688-201ENSMUST00000176779 512 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm28030-201ENSMUST00000184987 138 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm44200-201ENSMUST00000204883 662 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Erbb4-201ENSMUST00000119142 11782 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Ccdc18Q640L5 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms