Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Crem-206ENSMUST00000124747 973 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 5730412P04Rik-201ENSMUST00000147100 1149 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24186-201ENSMUST00000157983 127 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22160-201ENSMUST00000158405 328 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Pagr1a-201ENSMUST00000162069 422 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Fabp7-202ENSMUST00000165013 880 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm28840-203ENSMUST00000187128 975 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 A530021J07Rik-203ENSMUST00000208111 308 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC147240.1-201ENSMUST00000218767 431 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 C87977-203ENSMUST00000105755 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC124569.3-201ENSMUST00000224860 1621 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mnat1-202ENSMUST00000187549 3688 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn1r27-203ENSMUST00000228530 3115 ntAPPRIS P2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm25176-201ENSMUST00000122640 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Stau2-208ENSMUST00000144138 585 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Pid1-206ENSMUST00000176822 1119 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Rps12-ps21-201ENSMUST00000178172 402 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm9569-201ENSMUST00000187492 787 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Il6-202ENSMUST00000195978 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm19708-201ENSMUST00000199386 543 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC125041.1-201ENSMUST00000218264 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm40692-201ENSMUST00000220411 491 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 n-R5s173-201ENSMUST00000082620 119 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Pi15-201ENSMUST00000088476 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm7792-201ENSMUST00000201555 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Slc22a27-202ENSMUST00000182102 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm42686-201ENSMUST00000199172 4108 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
ptchd1Q14B62 Gm37964-201ENSMUST00000192459 4905 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms