Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Cdh19-201ENSMUST00000094626 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 1810006J02Rik-201ENSMUST00000186473 1687 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Abi3bp-203ENSMUST00000096013 4495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm28362-201ENSMUST00000189430 2420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm14681-201ENSMUST00000118047 411 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Klrd1-203ENSMUST00000119520 919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr406-201ENSMUST00000133561 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm13180-201ENSMUST00000141222 440 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm5368-201ENSMUST00000189012 589 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm37575-201ENSMUST00000195467 309 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm40155-201ENSMUST00000198291 818 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr220-202ENSMUST00000194229 3286 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Cp-205ENSMUST00000108329 4564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r39-203ENSMUST00000227285 2245 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr694-204ENSMUST00000216895 4853 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Txndc9-204ENSMUST00000193832 3472 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r27-201ENSMUST00000100968 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Ankrd31-201ENSMUST00000207464 5146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Trbv19-201ENSMUST00000103276 566 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm26145-201ENSMUST00000104476 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm24727-201ENSMUST00000158231 144 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC153544.1-201ENSMUST00000217988 400 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Rpl21-ps14-201ENSMUST00000080279 483 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm43826-201ENSMUST00000199604 2612 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm8244-201ENSMUST00000121254 264 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm14101-201ENSMUST00000121502 473 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm26045-201ENSMUST00000157862 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm38166-201ENSMUST00000191660 471 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm5983-201ENSMUST00000197739 770 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Mir670hg-207ENSMUST00000211619 819 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC124729.1-201ENSMUST00000225327 976 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC117656.3-202ENSMUST00000225842 1055 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr1442-201ENSMUST00000057924 1065 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r185-207ENSMUST00000227695 5292 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Cyp3a13-201ENSMUST00000031741 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm38101-201ENSMUST00000193484 3557 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm17106-201ENSMUST00000105610 459 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm15377-201ENSMUST00000119594 246 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr1177-ps-201ENSMUST00000137895 921 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm26100-201ENSMUST00000157245 127 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm26354-201ENSMUST00000158221 129 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm22910-201ENSMUST00000178568 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Ttc21bQ0HA38 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms