Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Zfp667-202ENSMUST00000108562 3498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Ttc33-202ENSMUST00000081640 1583 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Ifi208-202ENSMUST00000169857 1767 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Usp9x-201ENSMUST00000089302 11887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Pih1h3b-201ENSMUST00000044806 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Btla-201ENSMUST00000063654 3235 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr588-ps1-201ENSMUST00000118682 4607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 4921539E11Rik-202ENSMUST00000097944 1683 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm26377-201ENSMUST00000102184 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm15555-201ENSMUST00000128832 713 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm25981-201ENSMUST00000157921 295 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm1553-201ENSMUST00000177934 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm22108-201ENSMUST00000177961 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm24798-201ENSMUST00000179334 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm28594-201ENSMUST00000187022 661 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 1700025M24Rik-203ENSMUST00000191524 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm3010-201ENSMUST00000198805 448 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm15679-201ENSMUST00000161244 1936 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Vmn1r32-201ENSMUST00000079584 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr788-202ENSMUST00000213222 4747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Cmah-206ENSMUST00000167746 9727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm1968-201ENSMUST00000100016 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Sult2a4-201ENSMUST00000108520 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14050-201ENSMUST00000117052 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Prl2c5-202ENSMUST00000126540 971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm21070-201ENSMUST00000182425 985 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm4707-202ENSMUST00000183937 276 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm20203-201ENSMUST00000192352 332 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm43104-201ENSMUST00000197234 311 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 AC158142.1-201ENSMUST00000226721 416 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Sult2a2-201ENSMUST00000086148 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Zfp72-202ENSMUST00000223163 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm24469-201ENSMUST00000104487 131 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Sh3bp1P55194 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms