Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC154368.1-201ENSMUST00000223465 205 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 0610010F05Rik-202ENSMUST00000093267 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Nebl-207ENSMUST00000132418 1734 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr235-206ENSMUST00000215407 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm45033-201ENSMUST00000206710 3167 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm14781-201ENSMUST00000078469 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mageb5-201ENSMUST00000082048 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm24608-201ENSMUST00000104381 136 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm15148-201ENSMUST00000117602 156 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm12387-201ENSMUST00000118573 955 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm15940-201ENSMUST00000156011 817 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm44724-202ENSMUST00000208251 531 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm16381-201ENSMUST00000220528 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC132237.2-201ENSMUST00000221702 1209 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm2001-201ENSMUST00000223236 503 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Smim15-204ENSMUST00000224390 645 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 CT010511.1-201ENSMUST00000224570 315 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Vmn1r80-204ENSMUST00000227471 6368 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr147-201ENSMUST00000056364 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Vmn1r47-201ENSMUST00000074881 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mup21-201ENSMUST00000077719 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm38212-201ENSMUST00000194081 2756 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr205-202ENSMUST00000213910 1650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr1130-202ENSMUST00000216580 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr1042-202ENSMUST00000215624 5096 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm12757-201ENSMUST00000119465 800 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm3788-201ENSMUST00000119949 136 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm26320-201ENSMUST00000157742 306 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm17153-201ENSMUST00000171314 490 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm7639-201ENSMUST00000212608 484 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AL772397.1-201ENSMUST00000216707 606 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC122924.1-201ENSMUST00000222044 163 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm22005-201ENSMUST00000082795 141 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mcmdc2-204ENSMUST00000140948 3249 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm44434-201ENSMUST00000203918 3745 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr729-202ENSMUST00000213163 4283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr1331-202ENSMUST00000106360 3230 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr186-202ENSMUST00000206463 2208 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr1366-202ENSMUST00000175637 3045 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm13386-201ENSMUST00000117677 124 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm13460-201ENSMUST00000121274 353 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm11350-201ENSMUST00000121436 870 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm26171-201ENSMUST00000158422 131 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps143-201ENSMUST00000176730 604 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm31693-201ENSMUST00000200150 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Hoxd10P28359 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms