Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Stk38l-201ENSMUST00000001675 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn2r113-201ENSMUST00000170322 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Dnah6-201ENSMUST00000064948 12652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn1r201-203ENSMUST00000226965 4741 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14933-201ENSMUST00000118840 481 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm12768-201ENSMUST00000120055 759 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15147-201ENSMUST00000122263 483 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm24719-201ENSMUST00000157520 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm2979-201ENSMUST00000193442 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Ighv1-44-201ENSMUST00000195597 352 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm34066-201ENSMUST00000210156 825 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm35262-201ENSMUST00000215133 267 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC161586.1-201ENSMUST00000223232 547 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Defb11-201ENSMUST00000051965 317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm24207-201ENSMUST00000082781 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Mir375-201ENSMUST00000083682 64 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 n-R5s69-201ENSMUST00000083872 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 CT009754.3-201ENSMUST00000220739 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC127281.1-201ENSMUST00000221075 3667 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm45413-201ENSMUST00000210389 3538 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Enox2-209ENSMUST00000167659 3632 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Scn2a-202ENSMUST00000100067 8690 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Asxl3-201ENSMUST00000097655 11697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Stag3-209ENSMUST00000162245 4123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr1043-204ENSMUST00000216028 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Pon3-201ENSMUST00000031773 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Tor1aip2-203ENSMUST00000097526 2589 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm25097-201ENSMUST00000104042 145 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Mir466f-4-201ENSMUST00000116930 121 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm15288-201ENSMUST00000126640 653 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm25826-201ENSMUST00000157090 137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm25439-201ENSMUST00000158280 131 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Dnaja1-ps-201ENSMUST00000162103 642 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps66-201ENSMUST00000173436 612 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Gm26928-201ENSMUST00000182674 572 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Hoxd9P28357 Trav23-201ENSMUST00000199137 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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