Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 4930550C14Rik-203ENSMUST00000215668 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Igkv8-18-201ENSMUST00000103390 395 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 2210407C18Rik-202ENSMUST00000108821 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13677-201ENSMUST00000120739 595 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Vmn1r-ps94-201ENSMUST00000122016 458 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm25555-201ENSMUST00000158078 111 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm29540-201ENSMUST00000188207 337 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 CR974429.1-201ENSMUST00000220877 827 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm14391-204ENSMUST00000109058 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm4211-201ENSMUST00000181103 2220 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm15170-201ENSMUST00000121593 2023 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Rbm31y-201ENSMUST00000179408 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm21379-201ENSMUST00000179772 1955 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Ncoa4-201ENSMUST00000111994 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Ubr4-212ENSMUST00000165860 15798 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Kcnrg-202ENSMUST00000225582 1821 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Tmem74-201ENSMUST00000067469 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AI987944-204ENSMUST00000206801 1701 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr1235-ps1-201ENSMUST00000117898 314 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm6305-201ENSMUST00000121027 1012 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm11582-201ENSMUST00000121041 236 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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Hoxb2P0C1T1 Gm17907-201ENSMUST00000173150 710 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm24863-201ENSMUST00000179499 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 1700060O08Rik-201ENSMUST00000185390 281 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm37503-201ENSMUST00000192088 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Mir6906-201ENSMUST00000198998 58 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm32780-201ENSMUST00000201402 540 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm19726-201ENSMUST00000205008 240 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Kap-201ENSMUST00000048032 707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Olfr965-201ENSMUST00000069342 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm22169-201ENSMUST00000083229 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Hoxb2P0C1T1 Gm45633-201ENSMUST00000210669 3253 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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