Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AA792892-201ENSMUST00000097477 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm9611-201ENSMUST00000100698 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Hmgb1-ps6-201ENSMUST00000119503 616 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm15840-201ENSMUST00000122099 943 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm3633-202ENSMUST00000163102 231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm29482-201ENSMUST00000187845 230 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 1700065J11Rik-201ENSMUST00000201560 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Tgif1-ps-201ENSMUST00000201864 736 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm9560-201ENSMUST00000205012 1201 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm10709-201ENSMUST00000213318 480 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm40787-201ENSMUST00000218056 317 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC154417.1-201ENSMUST00000223876 476 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm24029-201ENSMUST00000083928 143 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Olfr1026-202ENSMUST00000217615 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm8104-201ENSMUST00000168165 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Vmn2r80-201ENSMUST00000165834 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm38224-201ENSMUST00000191648 2100 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm7298-201ENSMUST00000204124 4657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Mtx3-201ENSMUST00000076169 6275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Mir592-201ENSMUST00000102113 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Trav6-1-201ENSMUST00000103571 338 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Traj46-201ENSMUST00000103696 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm12509-201ENSMUST00000118033 609 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm12852-201ENSMUST00000119478 719 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm14919-201ENSMUST00000120839 390 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm6175-201ENSMUST00000121351 400 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Pfdn5-208ENSMUST00000170627 330 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm20526-201ENSMUST00000173416 158 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm8532-201ENSMUST00000179174 461 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm27255-201ENSMUST00000184303 529 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm28255-201ENSMUST00000187101 694 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm28552-201ENSMUST00000190725 388 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm38015-201ENSMUST00000193048 188 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm43779-201ENSMUST00000196691 829 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 9330198I05Rik-201ENSMUST00000196846 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm43215-201ENSMUST00000199108 252 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm43945-201ENSMUST00000203595 754 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 BC024386-203ENSMUST00000209817 825 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Olfr593-202ENSMUST00000210686 951 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Ifitm6-203ENSMUST00000211330 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC152979.1-201ENSMUST00000218214 289 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 4930555G07Rik-202ENSMUST00000219879 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Mir7-2-201ENSMUST00000083675 97 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gm2035J3QP87 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms