Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1310-202ENSMUST00000213559 4897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr670-202ENSMUST00000214216 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm8681-201ENSMUST00000219115 618 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Dst-202ENSMUST00000097786 17212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Igkv5-48-201ENSMUST00000103364 360 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Etd-201ENSMUST00000074232 478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Trim30a-201ENSMUST00000076922 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp942-201ENSMUST00000074295 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm16353-201ENSMUST00000159458 1223 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm3030-201ENSMUST00000163410 516 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp169-202ENSMUST00000167682 411 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm28747-201ENSMUST00000185366 571 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm29259-201ENSMUST00000186396 694 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm42593-201ENSMUST00000198469 377 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm32591-202ENSMUST00000204063 403 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC154552.2-201ENSMUST00000223117 794 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC154841.1-201ENSMUST00000227263 1479 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Nck1-201ENSMUST00000112874 1513 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm20476-201ENSMUST00000172644 492 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC153532.3-201ENSMUST00000218660 3848 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Zfp455-201ENSMUST00000117110 2556 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Slco1a1-202ENSMUST00000168119 3904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm20276-201ENSMUST00000216122 2648 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm24734-201ENSMUST00000158860 262 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm4761-201ENSMUST00000178086 582 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
NebE9Q1W3 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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