Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Themis-202ENSMUST00000060409 2278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slco1a5-201ENSMUST00000081380 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trhr-202ENSMUST00000110289 1745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr491-202ENSMUST00000209545 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn34b4-201ENSMUST00000101419 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14816-201ENSMUST00000117174 294 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s30-201ENSMUST00000122624 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24739-201ENSMUST00000158855 292 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25025-201ENSMUST00000175018 111 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8356-203ENSMUST00000178896 615 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2310001H17Rik-201ENSMUST00000180379 521 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37698-201ENSMUST00000192605 463 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8197-201ENSMUST00000192906 363 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7682-201ENSMUST00000198467 58 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL645546.1-201ENSMUST00000225001 189 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinb3d-201ENSMUST00000023861 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1197-201ENSMUST00000099815 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsfy2-201ENSMUST00000062085 1392 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr769-203ENSMUST00000216906 4325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r81-205ENSMUST00000228764 13763 ntAPPRIS P2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r74-202ENSMUST00000228471 6608 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc73-201ENSMUST00000111114 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr111-202ENSMUST00000214259 2620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14636-202ENSMUST00000150801 5060 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem167-201ENSMUST00000012566 1541 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr815-202ENSMUST00000216182 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmrn1-203ENSMUST00000204333 4472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930415L06Rik-201ENSMUST00000088146 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
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