Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm6520-201ENSMUST00000200636 410 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm34158-201ENSMUST00000216390 567 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm46369-201ENSMUST00000221577 401 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Olfr705-201ENSMUST00000060879 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Ang6-201ENSMUST00000096869 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Abi1-205ENSMUST00000123948 3067 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Vmn1r79-202ENSMUST00000226953 5636 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Gm12290-201ENSMUST00000145095 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gpr65-201ENSMUST00000075072 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Vmn1r44-205ENSMUST00000226345 1965 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gabrp-201ENSMUST00000020366 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Olfr132-202ENSMUST00000216804 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Acvr1c-202ENSMUST00000100085 4289 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Otc-201ENSMUST00000049910 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Foxp2-201ENSMUST00000031545 5647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Psd3-201ENSMUST00000038959 11319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Psd3-205ENSMUST00000098696 11316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Slco6d1-201ENSMUST00000027575 2328 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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Smg9Q9DB90 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm24504-201ENSMUST00000157679 100 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Smg9Q9DB90 Ighv2-8-201ENSMUST00000193935 262 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
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