Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm15988-201ENSMUST00000118677 367 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14162-201ENSMUST00000121985 601 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm12701-201ENSMUST00000134206 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm8121-201ENSMUST00000153583 499 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Snora81-201ENSMUST00000157310 178 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm24860-201ENSMUST00000158457 276 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm28873-201ENSMUST00000186130 667 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700066N21Rik-201ENSMUST00000190123 783 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm18553-201ENSMUST00000194152 634 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm6260-202ENSMUST00000197170 921 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 4930519L02Rik-202ENSMUST00000200254 452 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm44266-201ENSMUST00000205235 500 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Ifitm6-202ENSMUST00000209328 678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm45593-201ENSMUST00000211415 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC168059.1-201ENSMUST00000225846 841 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm10794-201ENSMUST00000099624 207 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm18853-201ENSMUST00000183629 3596 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 9230019H11Rik-201ENSMUST00000095874 2801 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr301-201ENSMUST00000174362 1937 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Vmn1r6-207ENSMUST00000228285 7950 ntAPPRIS P2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm43027-201ENSMUST00000202906 3691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Ccdc152-202ENSMUST00000226261 1327 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm37393-201ENSMUST00000195118 3870 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gnrh1-201ENSMUST00000111095 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm4758-201ENSMUST00000114851 291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm13349-201ENSMUST00000118436 411 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14793-201ENSMUST00000118739 311 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Smt3h2-ps-201ENSMUST00000121084 285 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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RpainQ9CWY9 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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RpainQ9CWY9 Olfr512-202ENSMUST00000209620 1056 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
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RpainQ9CWY9 Gm18644-201ENSMUST00000211458 815 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 AC154600.1-201ENSMUST00000226480 714 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Anapc13-201ENSMUST00000038673 411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr512-201ENSMUST00000074730 1056 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm22810-201ENSMUST00000082741 158 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Olfr391-ps-201ENSMUST00000214485 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gpr21-201ENSMUST00000065441 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
RpainQ9CWY9 Scn7a-201ENSMUST00000042792 7338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Gm43990-201ENSMUST00000203790 1691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
RpainQ9CWY9 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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