Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm26691-203ENSMUST00000200444 479 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm30893-201ENSMUST00000220479 903 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC117797.2-201ENSMUST00000224419 531 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr372-202ENSMUST00000215324 3542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr711-201ENSMUST00000051715 3035 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 4931412I15Rik-201ENSMUST00000207844 1448 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1104-203ENSMUST00000215972 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1317-204ENSMUST00000216988 2488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm11775-201ENSMUST00000136500 773 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Jpx-201ENSMUST00000181020 3802 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Ikzf2-209ENSMUST00000191262 1146 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm37291-201ENSMUST00000195637 533 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm42566-201ENSMUST00000197120 643 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm44389-201ENSMUST00000203795 182 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 2010106E10Rik-201ENSMUST00000026602 1257 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 1700080O16Rik-201ENSMUST00000033449 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
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Usp38Q8BW70 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC154636.3-201ENSMUST00000221489 1214 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Scgb1b2-201ENSMUST00000080635 424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Gm25131-201ENSMUST00000082653 151 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr1256-201ENSMUST00000099763 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 Olfr955-203ENSMUST00000220176 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Usp38Q8BW70 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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