Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm37504-201ENSMUST00000192537 2374 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Pde1a-205ENSMUST00000102654 4122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr728-202ENSMUST00000213685 7087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm14647-201ENSMUST00000119392 680 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm6947-201ENSMUST00000186254 78 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm37565-201ENSMUST00000192277 491 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm32340-201ENSMUST00000192883 259 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Spcs2-202ENSMUST00000207063 727 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr1492-ps1-201ENSMUST00000207071 865 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Vmn1r31-204ENSMUST00000226390 912 ntAPPRIS P2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Olfr943-201ENSMUST00000071617 1079 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Ros1-201ENSMUST00000020045 7401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Vmn2r35-201ENSMUST00000169683 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Ccdc18Q640L5 Gm15180-201ENSMUST00000117745 492 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps2-201ENSMUST00000118464 834 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm37288-201ENSMUST00000193963 334 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Mgst1-208ENSMUST00000204628 471 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm45006-201ENSMUST00000206078 690 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm20342-201ENSMUST00000185480 9720 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Pik3c2a-201ENSMUST00000170430 8044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1085-203ENSMUST00000214566 5129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm18913-201ENSMUST00000204311 1789 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm13557-201ENSMUST00000120771 382 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 n-R5s45-201ENSMUST00000122592 110 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm24380-201ENSMUST00000122696 324 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm24537-201ENSMUST00000157950 102 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm29105-201ENSMUST00000187256 450 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm31831-202ENSMUST00000198581 278 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 4930469K13Rik-202ENSMUST00000223852 537 ntAPPRIS P5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr131-201ENSMUST00000059560 1030 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr711-202ENSMUST00000207200 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm42993-201ENSMUST00000196856 7325 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm5829-201ENSMUST00000191383 351 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 4930402F11Rik-201ENSMUST00000207348 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 4930455B14Rik-204ENSMUST00000224776 848 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn2r82-201ENSMUST00000170596 3045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1368-202ENSMUST00000216039 1389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr741-202ENSMUST00000205518 3406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Fancb-201ENSMUST00000057150 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm28803-201ENSMUST00000190385 764 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm42610-201ENSMUST00000196557 650 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1295-202ENSMUST00000207786 1043 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr1456-ps1-201ENSMUST00000087769 518 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 2610002M06Rik-201ENSMUST00000120722 5842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Depdc1a-203ENSMUST00000120272 3323 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Ccdc18Q640L5 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms