Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm28625-201ENSMUST00000188309 205 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm38330-201ENSMUST00000192743 959 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm38356-201ENSMUST00000194313 408 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm3143-202ENSMUST00000198364 675 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC132384.5-201ENSMUST00000218562 226 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AV026068-224ENSMUST00000224827 928 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm5518-201ENSMUST00000084171 648 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr143-201ENSMUST00000093865 942 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r108-201ENSMUST00000167314 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Ghr-208ENSMUST00000161561 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Cfh-202ENSMUST00000111976 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Cfh-201ENSMUST00000066859 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr44-202ENSMUST00000215065 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm14443-201ENSMUST00000109054 4516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm42768-201ENSMUST00000197734 2897 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr109-204ENSMUST00000217602 5437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr665-202ENSMUST00000215761 2522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm23063-201ENSMUST00000102350 93 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm12118-201ENSMUST00000119766 532 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Spin2-ps4-201ENSMUST00000126395 762 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Spin2-ps3-201ENSMUST00000148147 762 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm26746-201ENSMUST00000181722 487 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm27864-201ENSMUST00000183704 190 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Mir6374-201ENSMUST00000184003 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Scgb2b32-ps-201ENSMUST00000190326 337 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm36964-201ENSMUST00000191876 198 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm13266-203ENSMUST00000193364 421 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 9530022L04Rik-201ENSMUST00000194340 310 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm43601-201ENSMUST00000196294 945 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm44972-201ENSMUST00000206419 406 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm44864-201ENSMUST00000207292 505 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 AC140344.1-201ENSMUST00000223384 387 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Gm40884-201ENSMUST00000223505 541 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Tc2n-202ENSMUST00000160715 1386 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
Cpne9Q1RLL3 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Nlrp4b-202ENSMUST00000117413 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r14-202ENSMUST00000227209 6857 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Olfr1186-203ENSMUST00000216978 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 4932414N04Rik-201ENSMUST00000055930 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Olfr679-202ENSMUST00000214328 5184 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm23257-201ENSMUST00000158322 132 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm23824-201ENSMUST00000158741 276 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Mpc1-ps-201ENSMUST00000181662 330 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm37343-201ENSMUST00000192542 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Olfr1244-ps1-201ENSMUST00000213226 683 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 2210414F02Rik-201ENSMUST00000215316 396 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm5917-201ENSMUST00000217638 721 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 AC125379.1-201ENSMUST00000221928 111 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 CT030194.1-201ENSMUST00000225507 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Nlrp9a-204ENSMUST00000122040 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm336-201ENSMUST00000186376 1480 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r49-203ENSMUST00000226368 6276 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Rab27b-203ENSMUST00000121693 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm45389-201ENSMUST00000211163 3399 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Olfr828-201ENSMUST00000104914 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Bsph2-201ENSMUST00000108526 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Cpne9Q1RLL3 Gm7363-201ENSMUST00000119883 399 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
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