Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Rps11-ps4-201ENSMUST00000062226 474 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Ppig-202ENSMUST00000090858 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Olfr739-202ENSMUST00000216949 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm10352-201ENSMUST00000166474 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Olfr812-203ENSMUST00000205013 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Pramel3-201ENSMUST00000113176 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm15553-201ENSMUST00000118757 430 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm12850-201ENSMUST00000119210 436 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Rpl23a-ps6-201ENSMUST00000119466 468 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm25433-201ENSMUST00000158283 286 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm23704-201ENSMUST00000158844 340 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm23774-201ENSMUST00000158990 131 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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Sh3bp2Q06649 AV026068-203ENSMUST00000185946 668 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Sh3bp2Q06649 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Sh3bp2Q06649 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 AC139758.1-201ENSMUST00000226573 930 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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Sh3bp2Q06649 Zfp760-201ENSMUST00000073312 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Sh3bp2Q06649 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Sugt1-201ENSMUST00000054908 7392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Sh3bp2Q06649 Jade3-201ENSMUST00000043693 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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Sh3bp2Q06649 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
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Sh3bp2Q06649 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm37375-201ENSMUST00000193859 387 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm37385-201ENSMUST00000195223 387 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm43651-201ENSMUST00000199796 439 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm43798-201ENSMUST00000202056 394 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 AC161383.1-201ENSMUST00000227356 527 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Sh3bp2Q06649 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms