Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Med14-203ENSMUST00000115481 3729 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr69-201ENSMUST00000106878 2829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Iglv2-201ENSMUST00000103752 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Defa-ps1-201ENSMUST00000119062 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Zfp456-202ENSMUST00000172266 679 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Mir7031-201ENSMUST00000183860 65 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm9722-201ENSMUST00000194568 802 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm43350-201ENSMUST00000196382 711 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm20039-201ENSMUST00000210329 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Sult6b1-201ENSMUST00000042683 839 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Spp1-204ENSMUST00000112747 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm10484-201ENSMUST00000196372 4759 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm14421-201ENSMUST00000121755 1958 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr919-202ENSMUST00000215612 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC154681.1-201ENSMUST00000225876 1735 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 4921501E09Rik-201ENSMUST00000024121 3916 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm12845-202ENSMUST00000204276 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm10745-201ENSMUST00000192022 1523 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps49-201ENSMUST00000177009 879 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Ptgs2-201ENSMUST00000035065 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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Sh3bp1P55194 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps122-201ENSMUST00000176687 906 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Mir1957b-201ENSMUST00000184608 123 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm37947-201ENSMUST00000192740 894 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm19418-201ENSMUST00000197436 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm9375-201ENSMUST00000208899 903 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Sprr2g-201ENSMUST00000056590 650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr1356-201ENSMUST00000061289 963 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Sh3bp1P55194 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
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