Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Mir5112-201ENSMUST00000174897 60 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Stx5a-215ENSMUST00000176570 563 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Obox3-ps8-201ENSMUST00000177182 960 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm37336-202ENSMUST00000193705 468 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Mir6994-201ENSMUST00000198985 73 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm45868-201ENSMUST00000210247 473 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC145736.1-201ENSMUST00000214661 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 CT030242.3-201ENSMUST00000221231 581 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC102291.1-201ENSMUST00000227164 529 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm23733-201ENSMUST00000083750 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm43166-201ENSMUST00000202871 4379 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm38351-201ENSMUST00000195466 2518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr689-202ENSMUST00000215413 5819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm36951-201ENSMUST00000193840 2687 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Rnf128-202ENSMUST00000113027 2641 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm13340-201ENSMUST00000117219 1545 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1209-202ENSMUST00000213136 5611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Mir883a-201ENSMUST00000104824 76 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm8214-201ENSMUST00000172123 351 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm5849-201ENSMUST00000180151 351 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm37223-202ENSMUST00000193592 490 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm38041-201ENSMUST00000194445 661 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Trav7n-5-201ENSMUST00000199753 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm43971-201ENSMUST00000205010 743 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC166358.4-201ENSMUST00000223030 105 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr52-201ENSMUST00000099905 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Gm14139-202ENSMUST00000109929 1485 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 AC154323.3-201ENSMUST00000226927 1660 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Clip3B9EHT4 Olfr1501-203ENSMUST00000215350 4395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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