Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Skint3-201ENSMUST00000038455 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm13650-201ENSMUST00000117729 433 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Tmsb15l-201ENSMUST00000127404 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm24059-201ENSMUST00000157493 312 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm9370-201ENSMUST00000222787 609 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 AC165366.1-201ENSMUST00000225905 505 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Rps15a-ps1-201ENSMUST00000071120 393 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm10287-202ENSMUST00000180599 4059 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Ssx9-201ENSMUST00000103001 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 R3hcc1l-202ENSMUST00000160107 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm16567-201ENSMUST00000160967 576 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm25037-201ENSMUST00000175418 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm43508-201ENSMUST00000197251 3783 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Spcs2-205ENSMUST00000207580 868 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Zfp62-201ENSMUST00000061757 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr535-207ENSMUST00000217235 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm38207-201ENSMUST00000193009 3505 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm10997-201ENSMUST00000210294 1500 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr586-202ENSMUST00000211075 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr263-202ENSMUST00000215804 3963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm44682-201ENSMUST00000208501 2614 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Vmn2r67-201ENSMUST00000168730 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Acbd7-201ENSMUST00000115089 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Mir3070b-201ENSMUST00000175205 89 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm29065-201ENSMUST00000188786 487 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 CT025611.2-201ENSMUST00000220475 879 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Vmn1r179-201ENSMUST00000049819 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Tas2r109-201ENSMUST00000067539 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 AC156560.3-201ENSMUST00000222978 3841 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr644-203ENSMUST00000213991 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm42552-201ENSMUST00000196754 4497 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr816-202ENSMUST00000213438 3306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm11640-201ENSMUST00000155987 272 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm22219-201ENSMUST00000157562 319 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 4930453C13Rik-201ENSMUST00000222376 765 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr357-201ENSMUST00000069578 1092 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 Gm43327-201ENSMUST00000199285 4055 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
PtprbB2RU80 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.28□□□□□ -1.89
PtprbB2RU80 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
PtprbB2RU80 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
PtprbB2RU80 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PtprbB2RU80 Ube2v2-204ENSMUST00000118236 893 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
PtprbB2RU80 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
PtprbB2RU80 Gm14586-201ENSMUST00000119571 408 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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