Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930555B12Rik-201ENSMUST00000135444 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23602-201ENSMUST00000157258 132 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28010-201ENSMUST00000179485 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930533P14Rik-201ENSMUST00000189056 583 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28920-201ENSMUST00000189957 699 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28822-201ENSMUST00000191140 778 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42926-201ENSMUST00000200496 697 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 3110043J17Rik-201ENSMUST00000219153 760 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC138718.1-201ENSMUST00000225947 1009 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tshb-201ENSMUST00000029450 605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyst-201ENSMUST00000110559 13181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1484-205ENSMUST00000216369 3764 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vwc2l-203ENSMUST00000161937 4323 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr959-202ENSMUST00000215194 4339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Csnka2ip-202ENSMUST00000209382 2859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1263-204ENSMUST00000217065 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230085B16Rik-201ENSMUST00000209781 1856 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r81-203ENSMUST00000227973 14002 ntAPPRIS P2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44371-201ENSMUST00000204148 467 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1498-ps1-201ENSMUST00000208721 991 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Znrd1as-204ENSMUST00000209623 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC114575.1-201ENSMUST00000218634 353 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126554.4-201ENSMUST00000221055 409 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC162934.1-201ENSMUST00000222880 309 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dapl1-201ENSMUST00000028369 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28044-201ENSMUST00000044819 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1465-201ENSMUST00000080142 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1314-201ENSMUST00000099598 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1180-203ENSMUST00000217320 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37789-201ENSMUST00000192862 2889 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45321-201ENSMUST00000209286 2863 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1500-204ENSMUST00000215760 2305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5447-201ENSMUST00000070258 1773 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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