Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3839S4R1W1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms