Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hdac5Q9Z2V6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac5Q9Z2V6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
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