Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Knop1Q9Z2Q2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Knop1Q9Z2Q2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms