Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Vamp5Q9Z2P8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Vamp5Q9Z2P8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Vamp5Q9Z2P8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Vamp5Q9Z2P8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Vamp5Q9Z2P8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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