Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Tulp1Q9Z273 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tulp1Q9Z273 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms