Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn8Q9Z260 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn8Q9Z260 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms